Microscopie Photonique

Présentation

Le plateau de Microscopie Photonique du BICeL, réparti sur les campus Santé, de la Cité Scientifique et de l’Institut Pasteur de Lille, propose un ensemble d’équipements et de compétences permettant la formation, le conseil et l’analyse en microscopie à fluorescence ou à fond clair.

Le plateau est ouvert à tous les utilisateurs académiques locaux, régionaux et nationaux ainsi qu’aux utilisateurs non-académiques issus de sociétés privées par exemple.

L’accès et le fonctionnement du plateau sont soumis à des règles définies dans les modalités d’accès aux plateaux du BICeL.

Les plateaux d’imagerie photonique du BICeL mettent à disposition des systèmes optiques variés permettant d’imager les échantillons fixés et/ou vivants aux différentes échelles : molécule, organite, cellule, tissu, organe et organisme entier.

Méthodes proposées :

  • Acquisitions multiparamétriques (multi-longueurs d’ondes (acquisition spectrale), multi-positions, au cours du temps, en épaisseur (Z-stack), en mosaïques…)
  • Imagerie in vivo du petit animal (explants et chambres optiques), microscopie multi-photonique (en animalerie).
  • Imagerie d’organes transparisés, microscopie à feuille de lumière (Ultramicroscope)
  • Microscopie virtuelle (scanner de lames)
  • Histologie et préparations d’échantillons : automate de coloration, histologie et immuno-marquage, coupes et inclusions.
  • Recouvrement de fluorescence après photoblanchiment (FRAP) (Spinning disk)
  • Fluorescence par transfert d’énergie (FRET)
  • Total Internal Reflection fluorescence (TIRF) (vidéo-microscope)
  • Technique de haute résolution : Airy scan, Live SR, et déconvolution (Huygens)

Applications :

  • Localisation, suivi et détermination de l’activité de molécules
  • Etude dynamique de la distribution d’organites cellulaires
  • Dynamique fonctionnelle des interactions moléculaires
  • Trafic membranaire
  • Survie cellulaire
  • Imagerie dans l’épaisseur du tissu (-/+ transparisé)
  • Etude longitudinale à long terme en chambre optiques (suivie de la croissance tumorale, tracking de cellules au court du temps).
  • Imagerie du petit animal corps entier en bioluminescence, fluorescence et XRay (compatible A2, boitte de confinement)

Les plateaux de microscopie photonique sont également source de conseils pour la mise en place de protocoles de traitements d’images et d’automatisations des analyses via les logiciels :

. ImageJ/Fiji et Icy (développement de macros)

. Imaris (Bitplane) : logiciel de reconstruction et quantification d’images 3-4-5 dimensions.

. Huygens (core): logiciel de déconvolution permettant d’améliorer la résolution et le rapport signal/bruit des images avec comme pré-requis, la connaissance des caractéristiques physiques et optiques du microscope et de l'échantillon.

. Logiciels de visualisation constructeur : Zen, LAS AF, Living image, Incucyte Zoom.